Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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