Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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