Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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