Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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