Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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