Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms