Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms