Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms