Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSBP2P81877 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms