Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms