Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LUMP51884 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LUMP51884 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LUMP51884 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms