Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASCL1P50553 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms