Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms