Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCR1P46094 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
XCR1P46094 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
XCR1P46094 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
XCR1P46094 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
XCR1P46094 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCR1P46094 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCR1P46094 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms