Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms