Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms