Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms