Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC1P15941 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms