Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms