Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms