Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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