Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F13BP05160 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13BP05160 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13BP05160 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms