Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHG1P01857 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms