Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV3-15P01624 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV3-15P01624 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms