Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms