Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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