Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DENRO43583 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DENRO43583 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DENRO43583 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms