Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms