Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms