Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms