Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms