Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms