Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ICE1Q9Y2F5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms