Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms