Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS5Q9UPZ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms