Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms