Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms