Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18L2Q9UHA2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms