Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms