Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COMMD8Q9NX08 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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