Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms