Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN4Q9NRL3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN4Q9NRL3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms