Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms