Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms