Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms