Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMG1Q96Q15 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms