Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRIPQ8WXE1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms