Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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