Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms