Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms